MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020567	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020567	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020567	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020567	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020567	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020567	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020567	TGA	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020567	ACAT	2	8	273	280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020567	TTAAAC	2	12	428	439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020567	AAGA	2	8	507	514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020567	TA	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020567	CAT	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020567	GCT	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020567	TTC	2	6	828	833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020567	C	6	6	845	850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_020567	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
18	NC_020567	TAG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
19	NC_020567	ATT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455814
20	NC_020567	CTTA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	0 %	25 %	472455814
21	NC_020567	ATC	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
22	NC_020567	GCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455814
23	NC_020567	CAT	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
24	NC_020567	T	7	7	1254	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
25	NC_020567	TGA	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
26	NC_020567	T	6	6	1461	1466	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
27	NC_020567	AAT	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455814
28	NC_020567	AGTA	2	8	1584	1591	50 %	25 %	25 %	0 %	472455814
29	NC_020567	TTC	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
30	NC_020567	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455814
31	NC_020567	TGT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455814
32	NC_020567	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
33	NC_020567	TTC	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
34	NC_020567	TAGA	2	8	1867	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	472455814
35	NC_020567	AC	3	6	1890	1895	50 %	0 %	0 %	50 %	472455814
36	NC_020567	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
37	NC_020567	CCA	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455814
38	NC_020567	GC	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	472455814
39	NC_020567	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455814
40	NC_020567	AGT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
41	NC_020567	TCA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
42	NC_020567	AGC	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455814
43	NC_020567	AC	3	6	2301	2306	50 %	0 %	0 %	50 %	472455814
44	NC_020567	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	472455814
45	NC_020567	ATA	2	6	2357	2362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455814
46	NC_020567	ATT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455814
47	NC_020567	CTT	2	6	2424	2429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
48	NC_020567	ACA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455814
49	NC_020567	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
50	NC_020567	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455814
51	NC_020567	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
52	NC_020567	TAG	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455814
53	NC_020567	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	472455814
54	NC_020567	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
55	NC_020567	TTC	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
56	NC_020567	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455814
57	NC_020567	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020567	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020567	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020567	CTT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020567	ACC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020567	CGTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020567	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020567	AC	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020567	GTAA	2	8	3290	3297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020567	TTC	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020567	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020567	TCTT	2	8	3423	3430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020567	ATC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020567	TTCA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020567	ATTT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020567	TAT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020567	TCA	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020567	GCAA	2	8	3501	3508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020567	TGAA	2	8	3514	3521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020567	AAGT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020567	AACG	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020567	ATA	2	6	3597	3602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020567	AAT	2	6	3618	3623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020567	A	6	6	3629	3634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020567	TAAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020567	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020567	ATT	2	6	3722	3727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020567	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020567	TGA	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020567	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020567	T	6	6	3829	3834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020567	TA	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020567	AAAT	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020567	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020567	ATA	2	6	3938	3943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020567	ATA	2	6	3950	3955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020567	TATT	2	8	3977	3984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020567	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455815
95	NC_020567	TTAA	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	472455815
96	NC_020567	TAT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455815
97	NC_020567	T	6	6	4257	4262	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
98	NC_020567	TTTA	2	8	4296	4303	25 %	75 %	0 %	0 %	472455815
99	NC_020567	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455815
100	NC_020567	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
101	NC_020567	TAATT	2	10	4360	4369	40 %	60 %	0 %	0 %	472455815
102	NC_020567	GTT	2	6	4421	4426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455815
103	NC_020567	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
104	NC_020567	TAT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455815
105	NC_020567	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455815
106	NC_020567	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
107	NC_020567	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455815
108	NC_020567	TTGAAG	2	12	4649	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455815
109	NC_020567	T	8	8	4746	4753	0 %	100 %	0 %	0 %	472455815
110	NC_020567	CAATTA	2	12	4814	4825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472455815
111	NC_020567	AAT	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455815
112	NC_020567	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
113	NC_020567	AAG	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
114	NC_020567	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
115	NC_020567	TTA	2	6	5005	5010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
116	NC_020567	T	6	6	5011	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	472455816
117	NC_020567	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455816
118	NC_020567	TC	3	6	5114	5119	0 %	50 %	0 %	50 %	472455816
119	NC_020567	TAA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
120	NC_020567	AAT	2	6	5140	5145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
121	NC_020567	AAGT	2	8	5163	5170	50 %	25 %	25 %	0 %	472455816
122	NC_020567	CATAA	2	10	5185	5194	60 %	20 %	0 %	20 %	472455816
123	NC_020567	ACC	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455816
124	NC_020567	ATA	2	6	5258	5263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
125	NC_020567	TTA	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
126	NC_020567	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
127	NC_020567	A	7	7	5375	5381	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
128	NC_020567	GATAC	2	10	5389	5398	40 %	20 %	20 %	20 %	472455816
129	NC_020567	A	8	8	5416	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
130	NC_020567	AT	3	6	5481	5486	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
131	NC_020567	AT	3	6	5538	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
132	NC_020567	TCT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455816
133	NC_020567	TAT	3	9	5613	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
134	NC_020567	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	472455816
135	NC_020567	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455816
136	NC_020567	TAT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455816
137	NC_020567	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	472455816
138	NC_020567	AT	3	6	5783	5788	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
139	NC_020567	CATT	2	8	5794	5801	25 %	50 %	0 %	25 %	472455816
140	NC_020567	AGA	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
141	NC_020567	TTAA	2	8	5833	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
142	NC_020567	AAG	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455816
143	NC_020567	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	472455816
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